কেন্দুয়া উপজেলার অবস্থান উত্তর অক্ষাংশের ২৪°৩৯' এবং ৯০°৫০.৫' দ্রাঘিমাংশে। উত্তরে নেত্রকোণা সদর ও আটপাড়া উপজেলা, পূর্বে মদন উপজেলা, দক্ষিণে কিশোরগঞ্জ জেলার তাড়াইল উপজেলা এবং ময়মনসিংহ জেলার নান্দাইল উপজেলা, পশ্চিমে ময়মনসিংহ জেলার ঈশ্বরগঞ্জ ও গৌরিপুর উপজেলা।